chip bs seq?

+32 голосов
спросил 06 Янв от secunda (1,040 баллов) в категории Қаржы кеңесшісі
20 ноя 2015 ... Для этого существует метод, который называется иммунопреципитация
хроматина с последующим секвенированием — ChIP-seq (от англ. .... От рака
вылечит… верблюд!;; Моноклональные антитела;; Saviс D., Patridge E.C.,
Newberry K.M., Smith S.B., Meadows S.K., Roberts B.S. et al. (2015).

11 Ответы

+75 голосов
ответил 06 Янв от anastas666 (640 баллов)
выбран 06 Янв
 
Лучший ответ

Installation Guide - Red Hat Customer Portal.

Although this manual reflects the most current information possible, read the Red Hat Enterprise Linux Release Notes for information that may not have been available prior to the documentation being finalized. The Release Notes can be found on the Red Hat Enterprise Linux CD #1, online at http://www.redhat.com/ docs/, ...
0 голосов
ответил 06 Янв от TerenceRose (980 баллов)
Here, we present sequential ChIP-bisulfite-sequencing (ChIP-BS-seq) as an approach to quantitatively assess DNA methylation patterns associated with chromatin modifications or...Sequential ChIP-bisulfite sequencing enables direct... - NCBI.

biocaddie omicseq

0 голосов
ответил 06 Янв от Nadi-N (730 баллов)

Научное издание.

29 апр 2016 ... районов геномов, полученных с помощью ChIP-seq экспериментов по определению районов связывания различных ... результаты 600 экспериментов ChIP-seq, проведенных на 26 образцах опухолей толстого кишечника и клеточных линий ...... B.S. Temirgali, O.L. Mezentseva,. Scientific ...
0 голосов
ответил 06 Янв от Marta-Styuart (600 баллов)

Лаборатория молекулярно-генетических систем (т.13).

Sokolov V.S., Zuraev B.S., Lashin S.A., Matushkin Yu.G. Russian .... 2014, 32(1): 115-126. Application of experimentally verified transcription factor binding sites models for computational analysis of ChIP-Seq data .... From binding motifs in ChIP-Seq data to improved models of transcription factor binding sites. Kulakovskiy I ...
0 голосов
ответил 06 Янв от mon1ca (600 баллов)
INPUT: BigWig files of ChIP-seq marks, and feature dataset in BED format. computeMatrix reference-point -S $Pol_II -R $GENCODE.v19 -a 2000 -b 2000 -out $OUTPUT -bs 25 -p 6...Visualization of ChIP-seq data using Heatmaps (Updated: 06/10/16).
0 голосов
ответил 06 Янв от Lopezzz (340 баллов)
[ChIP-seq. signal plot] How to align the based line of different samples? deeptools chip-seq normalization written 4 days ago by chiefcat • 70 • updated 2 hours ago by Dave Gerrard • 190.ChIP-Seq Posts.
0 голосов
ответил 06 Янв от UzzO (760 баллов)
I will do some analyses on BS-seq data(paired-end reads from Illumina).Is there anyone who have do the similar job like mine and could you give me some suggestions on choosing the BS-seq tools?Which BS-seq analysis tool to choose? | Forum - SEQanswers.

image

image

image

0 голосов
ответил 06 Янв от MxX555 (640 баллов)
Chip-seq methods typically only account for the 5' end coordinate of the alignment of the read in the genome, hence the results are mostly reduced to counts at given coordinates.ChIP seq basic terminology: what is a ChIP-seq tag?.
0 голосов
ответил 06 Янв от gromstals (650 баллов)

Подходы к анализу эпигенетических данных.

22 июл 2015 ... DNA метилом (BS-Seq). Регуляторные модификации хроматина. H3K4me3, H3K27me3 and. H3K36me3 (ChIP-Seq). GSE47819 http://www. aginghscepigenome.us. This data set will serve as a reference for future epigenomic analysis of stem cell aging. 1Гемопоэтические стволовые клетки ( ГСК, ...
0 голосов
ответил 06 Янв от MAXAOH (1,280 баллов)

Новый метод CETCh-seq может за одну метку поймать много ....

20 ноя 2015 ... Для этого существует метод, который называется иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием — ChIP-seq (от англ. .... От рака вылечит… верблюд!;; Моноклональные антитела;; Saviс D., Patridge E.C., Newberry K.M., Smith S.B., Meadows S.K., Roberts B.S. et al. (2015).
Добро пожаловать на сайт Jylyoi Q&A, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.

15,864 вопросов

155,134 ответов

0 комментариев

29,949 пользователей

...